я бы рекомендовал перенести доработки в расширения
далее вернуться вернуться к типовой конфигурации (на поддержке с вашими рекизвитами)
осуществить типовой переход с 2.0 на 3.0 (2.0.67.25 - 3.0.109.61)
далее с 3.0.109.61 обновить до 3.0.111.16
при необходимости доработать расширения