Налоговым периодом по НДФЛ является год. так как Ваш сотрудник раньше был нерезидентом, то налог у него удерживался по ставке 30%, а с 01.05.2015 вы зафиксировали смену его налогового статуса он...
учет зарплаты в БП сводный? тогда в БП 3.0 загружается только один документ - Зарплата (ЗУП 2.5, ЗИК 7.7).
Ведомости в БП 3.0 не нужны, можно пометить их на удаление