До этого и сейчас база работает на SQL (MS 2008) сервере.
Перенос был осуществлен на существующий виртуальный сервер 1С 8.3. Обнаружилась указанная проблема.
Подготовлен новый сервер i7-3770 32 ГБ два массива Raid-1 с двумя Samsung V-Nand SSD 860 PRO. На нем (он не нагружен) в одном сеансе пользователя наблюдаются те же проблемы.
Все 64х-разрядное - сервер, клиенты.
Пользователи работают через толстого клиента. Подключений в среднем 20-25.