1) База серверная или файловая?
2) Обновлялись в Автоматическом, т.е обновлялись в режиме 1с предприятие?
3) Есть ли возможность восстановить из резервной копии? в случае если обновлялись в режиме 1с предприятие база могла сохраниться. Если нет то можно попробовать отредактировать таблицы