В VBS скрипте есть один маленький не достаток, это касается 12 платформы, точную версию не помню. После отключения всех пользователей, может остаться подключение от самого скрипта, это ошибка самой 1с, скорее всего ее уже должны были исправить, не проверял! (скриптом пользовался года 3 назад, тоже его допиливал под себя)
Самый предпочтительный вариант удаленный рабочий стол. Можно организовать на любом семействе Windows начиная с XP. При VPN на удаленный машинах 1с будет медленно работать, придется увеличивать канал интернета, при RDP достаточно будет 512 Кб.