Володькин Данила Викторович

Совершенно верно. Индексация может быть вредна при совпадении 2 условий:
1) Размеры временных таблиц предсказуемы и очень малы (десятки/сотни строк).
2) Сам запрос выполняется крайне часто, и даже потерянные миллисекунды критичны.

Здесь же, похоже, речь идет о построении какого-то отчета или о заполнении таб.части документа. Ну, может быть, проведение документа. Судя по тому, что это задание здесь опубликовано с предложением "ускорить в несколько раз", миллисекунды погоды не сыграют )))

Потенциально тормозные места:

1) В первых нескольких запросах:

отсутствует индексирование получаемых таблиц. А потом эти таблицы участвуют в соединении. Решение - проиндексировать.

2) В середине есть запрос с кучей таких разименованией:

Вместо этого тоже лучше бы выполнять соединение в явном виде, причем в этом соединении может оказаться, что снова не хватает индексов.
Общая методика локализации простая: нарезаем пакет на отдельные запросы и засекаем время выполнения каждого.

Ах да. Оптимизировать могу, но во сколько раз - как уже здесь несколько раз указали, гадать бесполезно.