Думаю есть смысл настроить асинхронный Обмен с розницей по правилам обмена через электронную почту,
где электронная почта будет буфером обмена для файлов.
и протокол ошибок загрузки также можно отправлять на некоторую почту.
Если РАУЗ попробуйте уменьшить количество итераций решения СЛУ;
Попробовать разбить документ расчета себестоимости на несколько частей 1,2,3 в один документ 4,5 следующим документом