Вы конечно же выгрузили базу перед обновлением (*.dt). Создайте новую чистую базу, загрузите .dt. Проверьте была ли ошибка до обновления конфигурации. На всякий случай проверьте на старой и новой платформе. Если ошибки нет боятся нечего. На новой платформе проведите обновления, смотрите результат. В базе с ошибкой проведите "Тестирование и исправление", "Чем черт не шутит!".
СОЗДАЙТЕ КОПИЮ ПАПКИ С БАЗОЙ. Протестируйте файл базы *.1CD через обработку chdbfl.exe (с галочкой исправлять ошибки), которая в папке bin последней версии платформы. Должно все заработать.