Настроить работу механизма Интеркампани (2 Юрлица)

Для нашего управленческого учета необходимо настроить автоматическую передачу товаров между компаниями внутри холдинга по ценам себестоимости (без наценки).
Конфигурация Управление торговлей, редакция 11 (11.4.11.63)
Проблема:
Механизм настраивали самостоятельно. Сейчас товары передаются, минусовых остатков при закрытии месяца нет, но в разные регистры идет запись разных сумм себестоимости.
Пример одной отгрузки:
В отчете «Валовая прибыль по сделкам» – сумма себестоимости товаров - 41 061,31
В отчете «Доходы и расходы организации» сумма себестоимости - 42 520,59
В отчете «Ведомость по партиям товаров предприятия» сумма себестоимости - 41 125,29