1С Предприятие 8, УТ 11

1. В реализации, при проводке берем стоимость услуги доставки, и распределяем стоимость доставки пропорционально по всем товарам. Т.е. товар - джинсы, ценой 1000р и доставка, ценой 200р. При проводке цена доставки уменьшает стоимость джинс, и проводка идет как продажа по 800р (1000р-200р). Тоже само будет для нескольких товаров, т.е. цена доставки распределятся по цене товаров.
В итоге в документе цифры одни, а в проводке другие, следовательно и отчет по валовой прибыли будет считаться исходя из продажи в 800р.

2. Премии менеджерам - отчет по валовой прибыли с группировкой по менеджерам и расчетом премии. Премия менеджера рассчитывается как процент от валовой прибыли, процент берется из дополнительного реквизита менеджера (который нужно создать). Т.е. добавляется еще одна колонка в которой видим премию менеджера.
PS в отчете по валовой прибыли, корректно считаются все возвраты.