Штрих Кассир 5 -> Розница

Имеется Штрих Кассир 5. На РМК настроено и работает 2 Фискальных регистратора на две организации.
В Кассира выгружаются справочники номенклатуры из двух баз 1С Розница Базовая.
При работе на кассире продавцы выбирают секцию отдел куда пробивать чек на какой ФР. 1 или 2.
При закрытии смены Кассир выгружает отчет о розничных продажах в один файл, а в нем уже идет разбивка по секциям номенклатуры, другой возможности в Штрих кассире нет.
И этот файл загружать необходимо в обе базы Розницы в режиме ККМ Оффлайн.
Сейчас он загружается, но соответственно в Отчете о розничных продажах в каждой базе только своя номенклатура и пустые строки которые нужно удалять.
Необходимо сделать обработку что бы при открытии можно было выбрать номер секции и загрузить из файла отчета только данные нужного отдела.