Нужно комиссию 40руб брать сверху (в счете на оплату, платежке),а не в том числе.И тогда не будет задолженности и нечего распределять. Комиссия пойдет на доходы-расходы (банковские услуги).
Насколько помню, книга покупок собирается по РН "НДС покупки" (ну или как-то похоже он называется). Смотрите в нем данные за период 1 кв. 2026 г. по коду вида операции 17.