в 1с по регламенту запускается команда и вызывется plink
в нем выполняется команда и распаковывается файл sql
на новом сервере plink не принимает автоматом пароль а запрашивает его в диалоге
соответственно и команду потом нужно выполнять вручную
нужно настроить корректную работу приложения
что бы он и пароль и последующую команду выполнял в фоновом режиме