на 1с8 БП 2.0:
1) в док счет добавить операцию "Предзаказ", вывести эту колонку в журнал и форму списка
2) добавить в счет табличную часть "расшифровка" с реквизитом "НомерКнижки" тип строка и реквизитом "номер строки тч товары"; добавляем в тч "товары" реквизит "расшифровка" с типом "хранилище значения"
3) добавить в счет кнопку "расшифровка", которая должна работать так: 
3.1) становимся в счет на строку с тмц, жмем "расшифровка", открывается форма редактирования расшифровки с табличкой, 
в которую из реквизита "расшифровка" из тч товары выгружается сохраненная там табличка, если она там есть сохраненная.
3.2) в форме редактирования расшифровки в добавляем кнопку "загрузка из ексель". вешаем на нее механизм загрузки из файла екселя с выбором файла, выбором колонки и строки с и строки по
3.3) в форме редактирования расшифровки в добавляем кнопку "очистить", которая удаляет строки из таблички.
3.4) после закрытия формы редактирования расшифровки табличка из формы сохраняется в реквизит "расшифровка" соответствующей строки тч товары
3.5) при записи дока счет проходим по тч товары, читаем соответствующие реквизиты "расшифровка" и и инфу из них пишет в тч "расшифровка", т.е. номеркнижки бьерем из табл расшифровка. а "номер строки тч товары" - текущая строка тч товары. Это нужно для того, чтобы потом можно было запросы делать
4)новый документ "Медкнижки" - с тч "медкнижки". с реквизитом "номер книжки" строка, "категория" (спр ТМЦ), кнопка "загрузка из ексель". которая грузит из екселя номера книжек (с выбором файла, выбором колонки и строки с и строки по) и категории (сравнивает и ищет из спр тмц по названию)
5) отчет, который сравнивает за период информацию по номерам книжек из документов "Медкнижки" и тч "Расшифровка" из док "счет"

шаблон отчета и формы загрузки из екселя дам
если будут идеи как это можно по-другому сделать, то я не против

в дальнейшем надо будет это все тестить, показывать пользователям, и развивать дальше